Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF3AQ92664 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms