Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA6DQ8NFY4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms