Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BEST2Q8NFU1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BEST2Q8NFU1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms