Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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