Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSIP1Q8NA03 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms