Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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DTX3Q8N9I9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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DTX3Q8N9I9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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DTX3Q8N9I9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX3Q8N9I9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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