Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLDN19Q8N6F1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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