Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD35Q8N283 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD35Q8N283 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms