Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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