Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC46A3Q7Z3Q1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC46A3Q7Z3Q1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms