Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC80Q76M96 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms