Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSH2Q76I76 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms