Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM43BQ6ZT52 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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