Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms