Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LIAT1Q6ZQX7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms