Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HRCT1Q6UXD1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms