Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC1Q6TDU7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms