Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUX4L9Q6RFH8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms