Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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