Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms