Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms