Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C3orf33Q6P1S2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 349.2 ms