Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF544Q6NX49 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms