Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms