Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF6Q6KF10 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDF6Q6KF10 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms