Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms