Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CREB3L3Q68CJ9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CREB3L3Q68CJ9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms