Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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COL5A1-AS1Q5SY13 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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