Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms