Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTXN3Q4LDR2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTXN3Q4LDR2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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