Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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KRTAP13-3Q3SY46 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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KRTAP13-3Q3SY46 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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KRTAP13-3Q3SY46 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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KRTAP13-3Q3SY46 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
KRTAP13-3Q3SY46 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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KRTAP13-3Q3SY46 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-3Q3SY46 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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