Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms