Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL40Q2TBA0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms