Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TYSND1Q2T9J0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms