Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KNOP1Q1ED39 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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