Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC142Q17RM4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC142Q17RM4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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