Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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