Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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