Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN3Q16667 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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