Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FXNQ16595 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FXNQ16595 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FXNQ16595 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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