Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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