Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNGA3Q16281 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CNGA3Q16281 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CNGA3Q16281 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CNGA3Q16281 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CNGA3Q16281 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CNGA3Q16281 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CNGA3Q16281 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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