Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC1Q15915 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms