Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SF1Q15637 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SF1Q15637 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SF1Q15637 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SF1Q15637 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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