Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms