Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SEC23BQ15437 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms