Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFRLQ15198 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDGFRLQ15198 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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