Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms