Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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CLCA4Q14CN2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CLCA4Q14CN2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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CLCA4Q14CN2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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CLCA4Q14CN2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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CLCA4Q14CN2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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CLCA4Q14CN2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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CLCA4Q14CN2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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CLCA4Q14CN2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLCA4Q14CN2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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