Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMCO1Q147U7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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